امیر قلعهنویی در حال حاضر سرمربی تیم ملی است ولی دوران حضورش در استقلال همواره بسیار خبرساز بود. امیر ۲۰ خرداد سال ۹۲ در گفتوگوی اختصاصی با خبرورزشی به فاصله یک ماه پس از اینکه استقلال را قهرمان لیگ دوازدهم حرفهای کرد، گفت: هر وقت من از وجود پژمان منتظری در دفاع راست استفاده میکردم مورد انتقاد قرار میگرفتم ولی کارلوس کیروش همین کار را کرد و هیچ انتقادی هم در کار نبود چون من چشمآبی نیستم!
قلعهنویی در ادامه این مصاحبه با اشاره به اینکه در آن مقطع با استقلال قرارداد ۲ ساله داشت، ادامه داد: وقتی دیدم استقلال پول ندارد، احساس تکلیف کردم که بمانم تا بعدا نگویند قلعهنویی پولکی است اما واقعا اگر احساس کنم داستان مار و پله شروع شده، ممکن است تصمیم عوض شود چون دوست ندارم به خاطر من استقلال و طرفدارانش لطمه بخورند. الان هم اعتراف میکنم اگر من بگویند تو برو تا استقلال و طرفدارانش لطمه نخورند، مثل بچه خوب چمدانهایم را جمع میکنم و میروم.