جواد نکونام در هر تیمی که کار کرده روی اصول انضباطی بسیار حساس بوده است و تاکید دارد همه چیز باید کاملاً تحت کنترل سرمربی و دستیارانش باشد. یکی از مواردی که نکونام روی آن حساسیت بسیار ویژه‌ای دارد، آرام بودن فضای تیم هنگام برگزاری تمرینات و به ویژه در زمان برپایی اردوهای تدارکاتی و مسافرت‌هاست.
سرمربی استقلال به مسئولان باشگاه تاکید کرده است غیر از افرادی که خودش تحت عنوان حاضران در اردو لیست می‌دهد یا نفراتی که حضورشان به صورت موردی لازم است، هیچ فرد دیگری نباید قبل از مسابقات در اردوی استقلال حاضر شده و با مجموعه تیم به مسافرت بیاید چون تمرکز تیم کاملاً برایش اهمیت دارد و نمی‌خواهد یک حرکت غیرقابل پیش‌بینی باعث برهم خوردن آرامش استقلال شود. نکونام اصرار دارد حتی اگر قرار است عوامل باشگاه نیز در اردو حاضر شوند قبل از آن هماهنگی‌های لازم با او صورت بگیرد و بدون اجازه سرمربی چنین کاری انجام نشود.
این دقیقاً همان سیاستی بود که فرهاد مجیدی هم در لیگ بیست و یکم مد نظر قرار داد و البته موفق هم شد.
