استقلال در شهریور ماه سال ۱۳۹۹ توانست پرسپولیس را شکست بدهد و به فینال جام حذفی فصل ۹۸-۹۹ برسد. مسابقاتی که کاملا تحت تاثیر شیوع ویروس کرونا قرار گرفته و بدون حضور تماشاگران برگزار می‌شد.
دقیقا ۲۴ ساعت پس از پیروزی استقلال در دربی و رسیدن به فینال، فرهاد مجیدی به خاطر اختلاف نظر شدید با احمد سعادتمند از سمت خود کناره‌گیری کرد. البته با تلاش بازیکنان و مجید نامجومطلق دستیار اول او در آن مقطع، فرهاد دوباره به تمرینات بازگشت و استقلال برای انجام دیدار فینال مقابل تراکتور به سوی مشهد پرواز کرد. مسابقه‌ای که بسیار پرحاشیه بود و در نهایت تراکتوری‌ها با شکست آبی‌پوشان پایتخت قهرمان جام حذفی شدند. فرهاد مجیدی نیز کمتر از یک ساعت پس از پایان این بازی، کناره‌گیری خود را اعلام کرد و مدعی شد دیگر با این کادر مدیریت کار نمی‌کند.
وقتی کاروان استقلال به فرودگاه مهرآباد تهران رسید، میان تعدادی از بازیکنان با گروهی که خود را هواداران خشمگین استقلال می‌دانستند درگیری لفظی پیش آمد و پس از لحظاتی کار به گل‌آویز شدن طرفین و کتک‌کاری هم کشیده شد! استقلالی‌ها مدعی بودند این افراد هواداران استقلال نیستند بلکه توسط اشخاص خاصی اجیر شده‌اند. فرهاد مجیدی هم با صدای بلند به آن‌ها می‌گفت: چه کسی به شما پول داده تا این موقع شب به فرودگاه بیایید و این ماجراها را راه بیاندازید؟
گزارش این ماجرا همین‌طور که ملاحظه می‌کنید، روز پانزدهم شهریور ۱۳۹۹ به طور مفصل در خبرورزشی منتشر شد.
