بعد از ۶ سال حضور در پرسپولیس و کسب ۱۲ جام مختلف به همراه این تیم، سیامک نعمتی با نظر یحیی گل محمدی در لیست مازاد قرار گرفت و از پرسپولیس جدا شد. هرچند این اتفاق برخلاف نظر سیامک رخ داد، ولی سرمربی پرسپولیس در طول فصل گذشته نشان داد که دیگر روی این بازیکن حساب نمی‌کند و نعمتی به پایان کار خود در پرسپولیس رسیده است. پس از قطعی شدن جدایی سیامک از پرسپولیس ، باشگاه استقلال به این بازیکن پیشنهاد همکاری داد و مبلغ پیشنهادی استقلالی‌ها مناسب بود.

حتی شنیده شده که طرفین صحبت‌های اولیه را هم با هم انجام دادند ولی مذاکرات در همان مرحله اول متوقف شد. سیامک که همیشه در مصاحبه‌های خود عنوان کرده بود تحت هیچ شرایطی به استقلال نمی‌رود، روی حرفش ماند و در همان ابتدا پیشنهاد استقلال را رد کرد. نعمتی همیشه عنوان می‌کرد که یک پرسپولیسی است و خانواده ای پرسپولیسی دارد.سیامک در مصاحبه‌هایش عنوان می‌کرد که تحت هیچ شرایطی حاضر نیست پیراهن استقلال را برتن کند و به نظر می‌رسد به وعده خود به هواداران پرسپولیس عمل کرد و به پیشنهاد استقلالی‌ها پاسخ منفی داد.