از ابتدای فصل بیست و سوم لیگ برتر، باشگاه استقلال با حواشی زیادی روبرو شد. از اتفاقات روز معارفه و اولین تمرین آبی پوشان با نکونام تا برکناری حجت کریمی و حضور علی خطیر به عنوان مدیرعامل در این باشگاه.
حضور خطیر در باشگاه استقلال و جذب نشدن بازیکنان مدنظر نکونام توسط او باعث شعله ور شدن اختلافات بین آن دو شد تا جایی که نکونام در نشست های خبری خود بارها علیه خطیر صحبت کرد.
علی خطیر در این مدت بارها سکوت پیشه کرد و تنها در برنامه فوتبال برتر از نکونام خواست تا به این حواشی پایان دهد و هر دو برای موفقیت استقلال تلاش کنند.
حال در نظرسنجی سایت خبرورزشی بیش از ۲۳ هزار نفر در آن شرکت کردند، ۴۶.۴ درصد هر دو نفر را مقصر اتفاقات و اختلافات پیش آمده می دانند و ۳۷.۴ درصد هم علی خطیر و ۱۶.۲ درصد هم نکونام را مقصر می دانند.