سعید آقایی تا قبل از شروع بازی‌های لیگ قهرمانان آسیا یکی از بهترین‌های پرسپولیس و البته تنها دفاع چپ تخصصی این تیم بود، اما مثبت شدن تست کرونای سعید او را به قرنطینه فرستاد و این بازیکن کل بازی‌های مرحله گروهی لیگ قهرمانان را از دست داد.
بعد از بازگشت پرسپولیس از هند و منفی شدن تست کرونای سعید، او توانست در چند دیدار به صورت ثابت بازی کند ولی برخلاف قبل، گزینه اول یحیی نبود.
وحید امیری که به آچار فرانسه پرسپولیس معروف است آنقدر عملکرد خوبی در سمت چپ خط دفاعی نشان داد که حتی اسکوچیچ هم از وحید در پست مدافع چپ استفاده کرد. مصدومیت یک ماهه وحید که در دیدار تیم ملی مقابل بحرین اتفاق افتاد، آقایی را در چند بازی به مدافع چپ اصلی پرسپولیس تبدیل کرد ولی با آماده شدن امیری، سعید بار دیگر به یک نیمکت‌نشین تبدیل شد. نیمکت‌نشینی‌های آقایی باعث شد خیلی‌ها شایعه اختلاف این بازیکن و یحیی گل محمدی را مطرح کنند ولی پیگیری‌ها نشان می‌دهد نیمکت نشینی آقایی فنی بود.
بعد از اتمام لیگ و با داغ شدن اخبار نقل و انتقالاتی، پیشنهاد تراکتور به سعید آقایی مطرح شد و عده ای معتقد بودند سعید به تیم سابقش باز خواهد گشت. آنطور که شنیدیم نه پرسپولیس و یحیی برنامه ای برای فروش آقایی دارند و نه خود این بازیکن علاقه مند به ترک پرسپولیس است. آقایی یک فصل دیگر با پرسپولیس قرارداد دارد و تا پایان لیگ بیست و یکم بازیکن پرسپولیس خواهد بود.
