شبخ دیاباته، در سال ۱۳۹۸ با قراردادی ۲ ساله به جمع استقلالی ها اضافه شد و در مدت کوتاهی با عملکرد درخشانش در قلب هواداران آبی جای گرفت. او در فصل نوزدهم عنوان آقای گلی لیگ برتر را از آن خود کرد و با به ثمر رساندن ۱۹ گل به بهترین گلزن خارجی تاریخ استقلال تبدیل شد.
این بازیکن ۳۴ ساله با مصدومیت در دیدار مقابل نفت مسجد سلیمان و همچنین مصدومیت های پیاپی در تمرینات استقلال به مدت ۴ ماه از میادین دور بود و در ۵ دیدار مقابل حریف دیرینه موفق به گلزنی نشد و در نهایت در سال ۱۴۰۰ بدون دریافت جایزه کفش طلا در لیگ ایران با قراردادی قرضی به باشگاه الغرافه قطر رفت.
دیاباته در زمان بازی در قطر پیوسته از علاقه اش به حضور در ایران سخن گفت و ابراز کرد در صورت دریافت پیشنهاد حاضر به همکاری با قرمزپوشان خواهد بود تا به این ترتیب گمانه زنی ها برای حضور او در پرسپولیس قوت گیرد.
سرانجام در تاریخ ۱۰ شهریور ۱۴۰۱ بازیکن اسبق آبی ها با قرادادی ۱ ساله به پرسپولیس تهران پیوست.