به گزارش خبرورزشی، استقلال آذر سال ۱۳۹۸ با استراماچونی به صدر جدول رقابت‌های لیگ نوزدهم رسید اما سرمربی ایتالیایی وقت آبی‌پوشان با مدیران باشگاه دچار مشکلاتی شد و اتفاقاتی به وقوع پیوست که در نهایت زمینه را برای جدایی او فراهم کرد. در آن زمان مدیران باشگاه به شدت زیرتیغ انتقاد هواداران بودند و برای خارج شدن از آن فضا چاره‌ای نداشته‌اند جز اینکه یک چهره محبوب را جانشین استراماچونی کنند روی همین اصل سراغ فرهاد مجیدی رفتند و او را راضی کردند تا هدایت استقلال را بر عهده بگیرد. مجیدی هم در آن مقطع بزرگترین ریسک زندگی ورزشی خود را انجام داد و در پانزدهم دی سال ۹۸ قبول کرد جانشین مرد ایتالیایی شود. البته رسانه‌ها از ۴۸ ساعت قبل پیرامون این اتفاق اطلاع رسانی کرده بودند ولی پانزدهم دی ماه همه چیز قطعی شد و مجید نامجو مطلق نیز به عنوان دستیار اول کنار فرهاد قرار گرفت. مجیدی تا شهریور سال ۹۹ این سمت را بر عهده داشت اما پس از شکست مقابل تراکتور در فینال جام حذفی و البته اختلاف شدید با احمد سعادتمند مدیرعامل وقت آبی‌پوشان از سمت خود کناره‌گیری کرد. هرچند اسفند سال ۹۹ او دوباره به جمع استقلالی‌ها برگشت و سرانجام در بهار سال ۱۴۰۱ به اولین سرمربی تاریخ تبدیل شد که توانست استقلال را بدون حتی یک شکست قهرمان رقابت های لیگ برتر کند.